Full Circle Magazine FR

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**The core of any clinical research: is this hypothesis statistically significant? I am not a biostatistician, but I am often asked for basic statistics such as standard deviation, mean, and intraclass correlation coefficient. I have a Perl batch program that fulfills these demands. However, I am limited by the batch program. I only can generate simple tables, and no graphs.

There are commercial resources like Mathematica and Matlab that can develop a deeper analysis for research data sets. Yet yearly licenses and vendor contacts are required for these products. There are two other programs available: R and Gnuplot for Linux users.**

Voici le cœur de n'importe quelle recherche clinique : cette hypothèse est-elle statistiquement significative ? Je ne suis pas bio-statisticien, mais on me demande souvent de fournir des statistiques de base comme la déviation standard, la moyenne et le coefficient de corrélation intraclasse. J'ai un programme Perl par lots qui répond à ces demandes. Toutefois, je suis limité par le programme par lots. Je ne peux générer que des tables simples et aucun graphique.

Des ressources commerciales comme Mathematica et Matlab rendent possible le développement d'une analyse plus profonde d'ensembles de données de recherche. Et pourtant des licences annuelles et des contacts avec les vendeurs sont nécessaires pour ces produits. Deux autres programmes sont disponibles : R et Gnuplot pour les utilisateurs de Linux.

**R is the continuation of a math programming code called S. It is a full language used by statisticians. It is hailed as one of the easiest and most robust languages to learn and implement for work streams. Numerous people are learning this language. Further information can be found here: https://www.r-project.org/

Gnuplot is a command line tool that can generate tables and graphs. Gnuplot does not qualify for a totally free and open software. It is free to use, but in the same vein it is similar to Vanderbilt’s REDCap. It is a closed software tool, but any researcher can use it.
When I first used Linux Mint, I attempted to use a front end graphical program of Gnuplot. Yet it was not very reliable nor stable.  I recently became owner to a book titled Gnuplot in Action: Understanding Data with Graphs. I am hoping that my line of research in motion capture and pressure can be turned into graphs instead of tables. I review low back pain in the lumbar region and other pelvic landmarks such as the sacrum and pubic tubercles.

The motion data is generated as a comma separated value file. The pressure is a tab separated value file. I often blend these two files into one “mega file” that I process into generate a database. I will attempt to utilize the book, and see if i can apply it to my research line.**

R est la suite d'un code de programmation mathématique appelé S. C'est le langage complet utilisé par les statisticiens. Il est revendiqué comme étant l'un des plus faciles et robustes langages à apprendre et à implémenter pour les flux de travail. De nombreuses personnes apprennent ce langage. De plus amples renseignements se trouvent ici : https://www.r-project.org/

Gnuplot est un outil en ligne de commande qui peut générer des tables et des graphiques. Gnuplot ne répond pas à la définition d'un logiciel entièrement gratuit et ouvert. Son utilisation est gratuite, mais dans le même ordre d'idée il est similaire à REDCap de Vanderbilt. C'est un logiciel fermé, mais n'importe quel chercheur peut s'en servir.

Quand j'ai commencé à utilisé Linux Mint, j'ai essayé de me servir d'une interface graphique de Gnuplot, mais elle n'était ni très fiable ni stable. J'ai acquis récemment un livre appelé Gnuplot in Action: Understanding Data with Graphs (Gnuplot à l'œuvre : la compréhension graphique de données). J'ai l'espoir que l'orientation de mes recherches en capture de mouvement et pression puisse générer des graphiques à la place des tables. J'analyse des dorsalgies basses dans la région lombaire et d'autres repères pelviens comme les tubérosités du sacrum et du pubis.

Les données de mouvement sont générées sous la forme d'un fichier CSV et la pression donne un fichier TAB (où les valeurs sont séparées par une tabulation). Je fusionne souvent les deux fichiers en un seul fichier « méga-fichier » avec lequel je fais générer une base de données. J'essaierai d'utiliser le livre pour voir s'il peut s'appliquer au domaine de mes recherches.