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issue89:dcm4che

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issue89:dcm4che [2015/02/04 16:51] – [7] auntieeissue89:dcm4che [2015/02/08 17:44] (Version actuelle) – [4] d52fr
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 Il se peut que cet article n'ait pas été écrit pour une large gamme des lecteurs de cette revue, puisque je vais décrire l'installation d'un logiciel spécialisé en rapport avec le monde des entreprises médicales et de soins de santé.  Il se peut que cet article n'ait pas été écrit pour une large gamme des lecteurs de cette revue, puisque je vais décrire l'installation d'un logiciel spécialisé en rapport avec le monde des entreprises médicales et de soins de santé. 
  
-Ce n'est pas un logiciel que vous utiliseriez à la maison ; en effet, personne n'a d'installation de TEP (tomographie à émissions de positons) chez eux, n'est-ce pas ?+Ce n'est pas un logiciel que vous utiliseriez à la maison ; en effet, personne n'a d'installation de TEP (tomographie à émissions de positons) chez soi, n'est-ce pas ?
  
-J'ai peut-être tort, mais, en lisant des magazines comme celui-ci, j'ai l'impression que Ubuntu, Linux et les Logiciels Libres en général sont perçus par les gens comme quelque chose ayant un rapport avec, ou utile pour : +J'ai peut-être tort, mais, en lisant des magazines comme celui-ci, j'ai l'impression qu'Ubuntu, Linux et les logiciels libres en général sont perçus par les gens comme quelque chose ayant un rapport avec, ou utile pour : 
-• un violon d'Ingres de geek, de fans des ordinateurs et des programmeurs +• un violon d'Ingres de geek, de fans des ordinateurs et des programmeurs ; 
-• une manière gratuite et légale d'accomplir ses intérêts personnels ses tâches quotidiens en utilisant un PC (une alternative à Windows et aux logiciels payants), et notamment pour : +• une manière gratuite et légale d'accomplir ses intérêts personnelsses tâches quotidiennes, en utilisant un PC (une alternative à Windows et aux logiciels payants), et notamment pour : 
-• • multimédia et divertissement : jeux, retouche de photo et lecture de vidéos +   * multimédia et divertissement : jeux, retouche de photo et lecture de vidéos ; 
-• • la gestion de ses finances personnelles et domestiques +   * la gestion de ses finances personnelles et domestiques ; 
-• • une suite bureautique +   * une suite bureautique ; 
-• et pour une utilisation professionnelle, cela semble strictement lié à la technologie de l'informatique, comme quelque chose fait par les programmeurs pour d'autres programmeurs ou pour le personnel TI : +• et pour une utilisation professionnelle, cela semble strictement lié à la technologie de l'informatique, comme quelque chose fait par des programmeurs pour d'autres programmeurs ou pour le personnel TI : 
-• • outils réseau +   * outils réseau ; 
-• • serveur Web  et des trucs similaires +   * serveur Web  et des trucs similaires ; 
-• • langages de programmation et outils de développement +   * langages de programmation et outils de développement ; 
-• • n'importe quoi en rapport étroit avec la TI, l'informatique, les réseaux, etc. +   * n'importe quoi en rapport étroit avec la TI, l'informatique, les réseaux, etc. ; 
-• • et, enfin, quelque chose ayant trait aux affaires+   * et, enfin, quelque chose ayant trait aux affaires.
  
 Mais Linux et les Logiciels Libres ont d'autres aspects : dans la vraie vie, des choses sérieuses. Comme des applications de soins de santé... Mais Linux et les Logiciels Libres ont d'autres aspects : dans la vraie vie, des choses sérieuses. Comme des applications de soins de santé...
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 dcm4chee (http://dcm4che.org/) is a DICOM archive and image manager, that is the server side of a PACS system, the server where medical images (an x-ray, an ultrasound, a magnetic resonance) will be stored, and from which a radiologist will retrieve your examination in order to carry out a medical report.** dcm4chee (http://dcm4che.org/) is a DICOM archive and image manager, that is the server side of a PACS system, the server where medical images (an x-ray, an ultrasound, a magnetic resonance) will be stored, and from which a radiologist will retrieve your examination in order to carry out a medical report.**
  
-Ainsi, dans cet article, j'expliquerai comment installer dcm4chee sous Ubuntu. Comme je l'ai déjà dit, il se peut qu'aucun lecteur de cette revue n'ait ni le besoin ni les connaissances nécessaires à installer et à comprendre ce logiciel, mais si vous êtes étudiantou si vous connaissez un dentiste ou un cabinet de radiologie, savoir que ce logiciel existe pourrait vous inspiré.+Ainsi, dans cet article, j'expliquerai comment installer dcm4chee sous Ubuntu. Comme je l'ai déjà dit, il se peut qu'aucun lecteur de cette revue n'ait ni le besoinni les connaissances nécessaires à installer et à comprendre ce logiciel, mais si vous êtes étudiant ou si vous connaissez un dentiste ou un cabinet de radiologie, savoir que ce logiciel existe pourrait vous inspirer.
  
 DICOM et PACS DICOM et PACS
  
-DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine, ou l'Imagerie et le communications numériques en médecine) « est un standard dans l'imagerie médicale pour la manipulation, le stockage, l'impression et la transmission d'informations. » +DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine, ou l'Imagerie et les communications numériques en médecine) « est un standard dans l'imagerie médicale pour la manipulation, le stockage, l'impression et la transmission d'informations. » 
  
 PACS (Picture archiving and communication system, ou Système d'archivage et de communication d'images) est une technologie de l'imagerie médicale qui fournit le stockage de, et l'accès aux, images de modalités multiples. PACS (Picture archiving and communication system, ou Système d'archivage et de communication d'images) est une technologie de l'imagerie médicale qui fournit le stockage de, et l'accès aux, images de modalités multiples.
  
-Une modalité est une machine source dont viennent les images des malades, par exempleun appareil de radiographie ou un scanneur à résonance magnétique. Quelques autres acteurs d'un PACS sont : des serveurs, du stockage (NAS, SAN, bandes), des imprimantes, des visionneuses, des robots CD/DVD, etc.+Une modalité est une machine source dont proviennent les images des malades, par exemple un appareil de radiographie ou un scanneur à résonance magnétique. Quelques autres acteurs d'un PACS sont : des serveurs, du stockage (NAS, SAN, bandes), des imprimantes, des visionneuses, des robots CD/DVD, etc.
  
-dcm4chee (http://dcm4che.org/) est un gestionnaire d'archive et d'image DICOM, autrement dit le côté serveur d'un système PACS, le serveur où des images médicales (une radio, une échographie, une IRM) seront stocké et dont un radiologue récupérera l'examen pour pouvoir faire un rapport médical.+dcm4chee (http://dcm4che.org/) est un gestionnaire d'archive et d'image DICOM, autrement dit le côté serveur d'un système PACS, le serveur où des images médicales (une radio, une échographie, une IRM) seront stockées et à partir duquel un radiologue récupérera votre examen pour réaliser un rapport médical.
  
  
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 We need to accept the license, and so on.** We need to accept the license, and so on.**
  
-« L'application contient les services et interfaces HL7 de DICOM nécessaires pour fournir du stockage, de la récupération et de l'ordonnancement du travail à un environnement de soins de santé. » Écrite en Java, elle est pré-emballée et déployée au sein du serveur d'applications JBoss. Elle est Open Sources sous une licence triple, MPL/GPL/LGPL. Beaucoup d'outils en rapport avec DICOM sont fournis par les même développeurs et communauté (appelé dcm4che toolkit), ainsi que des visionneuses de DICOM, comme Mayam, Oviyam et Weasis.+//« L'application contient les services et interfaces HL7 de DICOM nécessaires pour fournir du stockage, de la récupération et de l'ordonnancement du travail à un environnement de soins de santé. »// Écrite en Java, elle est pré-emballée et déployée au sein du serveur d'applications JBoss. Elle est Open Source sous une licence triple, MPL/GPL/LGPL. Beaucoup d'outils en rapport avec DICOM sont fournis par les même développeurs et communauté (appelé dcm4che toolkit), ainsi que des visionneuses de DICOM, comme Mayam, Oviyam et Weasis.
  
-Si vous avez besoin d'aide, il y a un groupe Google où une communauté sympa et dynamique vous donnerait bien volontiers des conseils. En revanche, la documentation du wiki a quelques lacunes, c'est-à-dire que certaines pages sont périmées ou incomplètes.+Si vous avez besoin d'aide, il y a un groupe Google où une communauté sympa et dynamique vous donnera bien volontiers des conseils. En revanche, la documentation du wiki a quelques lacunes, c'est-à-dire que certaines pages sont périmées ou incomplètes.
  
-Installons-le+Installons-le.
  
-Même si une personne de bon cœur a créé un paquet .deb, et en débit du fait que j'aime beaucoup les gestionnaires de paquets, dans ce cas, je préfère installer le logiciel manuellement.+Même si une personne de bon cœur a créé un paquet .deb, et en dépit du fait que j'aime beaucoup les gestionnaires de paquets, dans ce cas, je préfère installer le logiciel manuellement.
  
 Voyons donc voir comment installer dcm4chee sur Ubuntu server 14.04 LTS. Voyons donc voir comment installer dcm4chee sur Ubuntu server 14.04 LTS.
  
-Tout d'abord, il faut installer Java. Je ne suis pas certain que dcm5chee fonctionne avec OpenJDK. Et je ne suis pas certain qu'il fonctionne avec Java 1.7 ; nous allons donc installer Oracle Java 1.6, au moyen d'un dépôt PPA.+Tout d'abord, il faut installer Java. Je ne suis pas certain que dcm4chee fonctionne avec OpenJDK. Et je ne suis pas certain qu'il fonctionne avec Java 1.7 ; nous allons donc installer Oracle Java 1.6, au moyen d'un dépôt PPA.
  
 sudo apt-get install software-properties-common sudo apt-get install software-properties-common
Ligne 143: Ligne 143:
 Put the zip files in a temporary folder, like /var/tmp/dcminstall and unzip them** Put the zip files in a temporary folder, like /var/tmp/dcminstall and unzip them**
  
-cdm4chee a besoin d'une base de données : Postgres, DB2, Oracle, MySQL... Si vous voulez l'essayer sans un RDBMS [Ndt : Relational Data Base Management System, ou base de données relationnelle], vous pouvez choisir le paquet HSQL, mais installons MySQL.+dcm4chee a besoin d'une base de données : Postgres, DB2, Oracle, MySQL... Si vous voulez l'essayer sans un RDBMS [Ndt : Relational Data Base Management System, ou base de données relationnelle], vous pouvez choisir le paquet HSQL, mais installons MySQL.
  
 sudo apt-get install mysql-server sudo apt-get install mysql-server
  
-Nous devons maintenant créer un schema et donner tous les droits à l'utilisateur.+Nous devons maintenant créer un schéma et donner tous les droits à l'utilisateur.
  
 $ mysql -uroot -p***** $ mysql -uroot -p*****
Ligne 286: Ligne 286:
 L'utilisateur par défaut est « admin » et le mot de passe par défaut est « admin ». L'utilisateur par défaut est « admin » et le mot de passe par défaut est « admin ».
  
-Pour pouvoir modifier la configuration par défault, nous devons utiliser le console jmx de JBoss http://yourubuntuserver:8080/jmx-console/, et cette tâche pourrait être difficile, car il n'existe pas de manuels qui donnent une configuration étape par étape : vous devez bien chercher sur le wiki ou le vieux forum ou, comme je l'ai déjà dit, vous pouvez lancer un appel à l'aide sur la liste de diffusion.+Pour pouvoir modifier la configuration par défaut, nous devons utiliser la console jmx de JBoss http://yourubuntuserver:8080/jmx-console/, et cette tâche pourrait être difficile, car il n'existe pas de manuels qui donnent une configuration étape par étape : vous devez bien chercher sur le wiki ou le vieux forum ou, comme je l'ai déjà dit, vous pouvez lancer un appel à l'aide sur la liste de diffusion.
  
 Pour plus de renseignements : Pour plus de renseignements :
 • wiki - http://www.dcm4che.org/confluence/display/proj/The+Project • wiki - http://www.dcm4che.org/confluence/display/proj/The+Project
-• liste de diffusion https://groups.google.com/forum/m/?hl=en#!forum/dcm4che +• liste de diffusion https://groups.google.com/forum/m/?hl=en#!forum/dcm4che 
-• forum abandonné http://forums.dcm4che.org+• forum abandonné http://forums.dcm4che.org
issue89/dcm4che.1423065090.txt.gz · Dernière modification : 2015/02/04 16:51 de auntiee